【中國(guó)投影網(wǎng)資訊】維爾康奈爾醫(yī)學(xué)院的3D沉浸式技術(shù)幫助開創(chuàng)生物醫(yī)學(xué)研究視覺新高度
客戶:維爾康奈爾醫(yī)學(xué)院奧瓦里-賓-塔拉-賓-阿杜拉西斯-沃蘇王子殿下計(jì)算機(jī)生物醫(yī)學(xué)研究院
地點(diǎn):紐約
行業(yè)/市場(chǎng):生物醫(yī)學(xué)研究
要求:
需要高分辨率圖像來觀看大量體積、空間和拓?fù)鋽?shù)據(jù)集
要求適合無比狹小的空間
概述:
4個(gè)表面沉浸式環(huán)境,包括配套層
8臺(tái)1920x1080科視Christie Mirage HD3
投影機(jī)
每個(gè)幕墻328萬像素
利用科視Christie Twist™精確、無縫
邊緣融合
比SXGA
分辨率高41%
跟蹤和交互設(shè)備,增強(qiáng)數(shù)據(jù)存在感
結(jié)果:
一流的3D科學(xué)研究圖像,包括分子建模、MRI和共聚焦圖像重建和基因圖譜建模
快速、正確的決策制定
與數(shù)據(jù)集更自然、更直觀的交互方法
全面了解生物醫(yī)學(xué)研究復(fù)雜機(jī)理
縮短新發(fā)現(xiàn)的時(shí)間
提供獨(dú)特的合作環(huán)境,幫助教學(xué)和探索過程
世界著名的醫(yī)學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中心有望研究出偉大的成果。位于奧瓦里-賓-塔拉-賓-阿杜拉西斯-沃蘇王子殿下計(jì)算機(jī)生物醫(yī)學(xué)研究院的戴威德科弗里生物醫(yī)學(xué)信息中心采用了3D沉浸式
技術(shù)。研究院的研究人員在該
技術(shù)幫助指導(dǎo)下在大量不同的領(lǐng)域中進(jìn)行探索發(fā)現(xiàn),從對(duì)短時(shí)記憶背后的機(jī)理提出新見解到闡明柯卡因和多巴胺如何在細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白中的神經(jīng)遞質(zhì)進(jìn)行合成,再到收集癮君子父母的孩子大腦結(jié)構(gòu)發(fā)育中有價(jià)值的縱向數(shù)據(jù)。
紐約維爾康奈爾醫(yī)學(xué)院成立于1898年,現(xiàn)在的紐約長(zhǎng)老教會(huì)醫(yī)院是它的附屬醫(yī)院,是美國(guó)頂級(jí)臨床和醫(yī)療研究中心。除提供醫(yī)學(xué)學(xué)位外,維爾康奈爾還在維爾康奈爾醫(yī)學(xué)研究生院設(shè)置有生物醫(yī)學(xué)研究和教育博士學(xué)科點(diǎn)。維爾康奈爾與相鄰的洛克菲勒大學(xué)和紀(jì)念斯。瓌P特琳癌癥中心合作組建了醫(yī)學(xué)博士學(xué)科點(diǎn),讓學(xué)生們強(qiáng)化他們對(duì)教育、研究和病人護(hù)理三重任務(wù)的追求。這幾個(gè)機(jī)構(gòu)一起組建了一個(gè)專業(yè)面廣的三院聯(lián)合研究企業(yè)。
維爾康奈爾醫(yī)學(xué)院的計(jì)算機(jī)生物醫(yī)學(xué)研究院的目的是在生物科學(xué)中實(shí)現(xiàn)計(jì)算機(jī)方法,如基因研究、分子建模、生物信息以及系統(tǒng)生物學(xué)。
為此,
技術(shù)管理團(tuán)隊(duì)與研究人員合作,取得下一代數(shù)據(jù)采集工具(如MRI和共焦顯微鏡)生成的3D數(shù)據(jù)集以及學(xué)院的超級(jí)計(jì)算機(jī)上計(jì)算生成的數(shù)據(jù)集,并將它們呈現(xiàn)在沉浸式3D環(huán)境中。結(jié)果得到了可以給研究帶來新視角的科學(xué)的可視化-在那里,研究人員可以非常快速地分析并得出結(jié)論,這用傳統(tǒng)的研究方法是不可能實(shí)現(xiàn)的。分析2D信息(如片段數(shù)據(jù))會(huì)耗費(fèi)幾天、幾周或幾個(gè)月的研究時(shí)間,還不一定能得到同樣全面的結(jié)論。
“我們采集數(shù)據(jù)集并以桌面上無法實(shí)現(xiàn)的方式將它們呈現(xiàn)出來。這可幫助您想象出以其它方式怎么也無法想象的事情,因?yàn)槟鷺O其快速地得到巨大的圖像,無需從無聯(lián)系的信息片段進(jìn)行推測(cè),”ICB的系統(tǒng)管理員Vanessa Borcherding解釋道!耙幻芯咳藛T可以將一個(gè)試驗(yàn)?zāi)P蛶У?D空間進(jìn)行共享、教學(xué)和合作。可得到廣闊的視野,并看見詳細(xì)的相互聯(lián)系。采用沉浸式
技術(shù)和可視化,您可以挑戰(zhàn)幫助進(jìn)一步理解的假設(shè)和總體發(fā)現(xiàn)過程。
圖像科學(xué)在醫(yī)學(xué)的各種領(lǐng)域起著越來越重要的作用。維爾康奈爾可視化實(shí)驗(yàn)室是世界上第一個(gè)
高清3D虛擬逼真環(huán)境。它使用目前最高
分辨率融合的圖像,投射在三面墻和一個(gè)配套層上。由主要使用者佩戴的互動(dòng)跟蹤裝置與手持式電子操縱桿配合操縱圖像,讓多名研究人員同時(shí)在三維數(shù)據(jù)集或結(jié)構(gòu)中“遨游”。他們能夠以幾乎無限的視角探索和操縱自己的模型,體驗(yàn)一種使用計(jì)算機(jī)桌面無法匹敵的無與倫比的沉浸感。
在CAVE內(nèi),圖像非常出眾。數(shù)據(jù)模型的各個(gè)角度的
高清視圖環(huán)繞著研究人員。輕輕地動(dòng)一下手腕就可改變圖像。圖像的元素被分層堆積在一起、分隔開來并選擇性地從屏幕上完全移走,以揭示相互之間的連通性。點(diǎn)擊一下就可放大圖像,直到科學(xué)家真實(shí)地站在他們的數(shù)據(jù)里面,能夠在用其它方法永遠(yuǎn)也看不到的景色和通道中穿行。它是對(duì)
技術(shù)無與倫比地使用,已經(jīng)引起了其它幾個(gè)醫(yī)學(xué)院校的興趣,他們正在考慮投資類似的
技術(shù)。
來自維爾康奈爾醫(yī)學(xué)院和哥倫比亞醫(yī)療中心的一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)合作進(jìn)行一項(xiàng)科學(xué)研究,利用ICB的CAVE來確定抗抑郁藥品、柯卡因和安非他明怎樣與腦細(xì)胞交相感應(yīng)。研究人員說:他們的突破性研究可能會(huì)為大批精神疾病的治療提供更有針對(duì)性的藥物治療鋪平道路,尤其是成癮方面的疾病。
“這些發(fā)現(xiàn)非常清楚,詳細(xì)到了分子行為的級(jí)別,它們對(duì)揭示情緒失調(diào)和神經(jīng)現(xiàn)精神疾病的更有效的治療非常有價(jià)值。
為了擴(kuò)充能力以研究大腦,科學(xué)應(yīng)用專家Luis Gracia博士使用哈佛開發(fā)的軟件創(chuàng)建了一個(gè)全自動(dòng)數(shù)據(jù)管線來拍攝2D MRI圖像或片段,并將它們重顯為全分段的3D電腦視圖。可以將生動(dòng)的圖像進(jìn)行扭曲和轉(zhuǎn)動(dòng),并可為了靠近觀察而放大到特別大的尺寸,以至于人被淹沒在大腦各區(qū)的色彩繽紛的、詳細(xì)分段視圖中。從這種虛擬模型中,研究人員仍能找出大腦發(fā)育不全的區(qū)域。
“采集2D數(shù)據(jù)并將其轉(zhuǎn)換成3D物體以快速作出決定的能力是此實(shí)驗(yàn)室特有的,”Borcherding評(píng)論道!八亲鍪虑榈母匀、直覺的方法。使用2D
技術(shù),您得不到對(duì)數(shù)據(jù)的身臨其境的感覺 – 確切地說是在您的數(shù)據(jù)中漫游的能力。它是不可思議的漂亮迷人的可視化方法。”
維爾康奈爾的科弗里中心是生物醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu)中唯一的這類實(shí)驗(yàn)室?梢暬行膹幕A(chǔ)開始設(shè)計(jì),其創(chuàng)建主要?dú)w功于David Cofrin博士的慷慨捐助,他與Harel Weinstein博士具有同樣的想法,想建造一個(gè)實(shí)驗(yàn)室以一種其它方式無法實(shí)現(xiàn)的方式對(duì)信息進(jìn)行可視化,Weinstein博士是生理學(xué)和生物物理學(xué)Maxwell M. Upson教授以及生理學(xué)和生物物理學(xué)系的主任,也是該研究院的院長(zhǎng)。可視化中心是奧瓦里-賓-塔拉-賓-阿杜拉西斯-沃蘇王子殿下計(jì)算機(jī)生物醫(yī)學(xué)研究院中的科弗里生物醫(yī)學(xué)信息中心的一部分。
實(shí)驗(yàn)室的沉浸式CAVE(計(jì)算機(jī)輔助虛擬環(huán)境)由8臺(tái)科視Christie Mirage HD3
投影機(jī)投射-是行業(yè)中第一個(gè)具有主動(dòng)立體能力的默認(rèn)1920x1080 HD
分辨率3片式DLP?
投影機(jī)。這種
投影機(jī)分辨比以前的投影
技術(shù)高41%,可輸出超級(jí)3D圖像,用于分子建模和生物醫(yī)學(xué)研究的其它數(shù)據(jù)密集領(lǐng)域。
CAVE
分辨率非常高-每個(gè)融合幕墻的象素?cái)?shù)為1920x1920,整個(gè)CAVE可解析多達(dá)14.74M象素。采用極其小巧的設(shè)計(jì),總占地面積(包括出入留余地)為25英尺寬X20英尺深X11.5英尺高。每個(gè)幕墻兩臺(tái)
投影機(jī),利用科視Christie Twist™融合
技術(shù)和科視的備選黑夜景觀光學(xué)融合創(chuàng)造無縫密合的圖像。系統(tǒng)使用100%數(shù)字信號(hào)傳輸,視頻信號(hào)路由全部通過Cat-5e完成,可讓信號(hào)從數(shù)據(jù)中心發(fā)送出去,設(shè)施對(duì)其影響極小。
科視在安大略省基奇納的制造工廠中對(duì)此解決
方案進(jìn)行了全面籌備。在籌備好解決
方案、復(fù)制好圖像發(fā)生器且安裝好客戶配置軟件后,邀請(qǐng)維爾康奈爾進(jìn)行工廠驗(yàn)收,在將CAVE發(fā)給他們前進(jìn)行查看和試用。
生理學(xué)和生物物理學(xué)系的研究人員Zeynep Hulya Gumus博士(其著作“煙草煙影響的基因表達(dá)和口腔黏膜白斑病細(xì)胞模型中細(xì)胞通路”發(fā)表在《癌癥防止研究》雜志2008年4月創(chuàng)刊號(hào)上)正在利用沉浸式可視化深入進(jìn)行自己的工作。與生理學(xué)系助理教授和
技術(shù)工程師以及管理CAVE實(shí)驗(yàn)室的
技術(shù)管理團(tuán)隊(duì)主管Jason Banfelder合作,她正在利用Banfelder和ICB其它成員編寫的專用應(yīng)用程序來幫助搞清楚生物網(wǎng)絡(luò)可以創(chuàng)造的大量混亂的數(shù)據(jù)的含義。
“用于基因和蛋白質(zhì)的分子交互作用網(wǎng)絡(luò)是我們理解正常細(xì)胞活動(dòng)以及患病狀態(tài)的基礎(chǔ),在藥物發(fā)現(xiàn)和生物標(biāo)志識(shí)別有重要的用途。
“大而復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)的可視化在
技術(shù)上具有挑戰(zhàn)性,但回報(bào)也是相當(dāng)大的,因?yàn)橛行У目梢暬椒ǹ梢詭韺?duì)生物醫(yī)學(xué)研究中復(fù)雜的機(jī)理的全面、直觀和融會(huì)貫通的理解,縮短發(fā)現(xiàn)和診斷所用的時(shí)間。我們正在進(jìn)行的研究是用CAVE
技術(shù)解決這個(gè)困難,以使我們能夠識(shí)別大的交互作用網(wǎng)絡(luò)的要素,展現(xiàn)對(duì)基本生物的洞察力,并建議潛在的藥物目標(biāo)。
作為世界著名的醫(yī)學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中心,維爾康奈爾醫(yī)學(xué)院的戰(zhàn)略定位是培養(yǎng)未來的醫(yī)生和科學(xué)家。研究生院招生和員工招聘是維爾康奈爾的重要任務(wù)。由于在其可視化中心有了
高清3D沉浸
技術(shù),學(xué)院提高了吸引高素質(zhì)學(xué)生和研究人員的能力,提供了在生物醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的進(jìn)行合作和將成果應(yīng)用到醫(yī)療中的更多的機(jī)會(huì)。